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dc.contributor.authorFranco, Matheus Eloy
dc.coverage.spatialUniversidade de Ribeirão Preto - UNAERPpt_BR
dc.date.accessioned2021-04-05T17:30:16Z
dc.date.available2021-04-05T17:30:16Z
dc.date.issued2015pt_BR
dc.identifier.urihttp://repositorio.unaerp.br//handle/12345/286
dc.description.abstractAs dermatófitoses são as infecções fúngicas mais comum no mundo, sendo caracterizada por lesões superficiais em pele, cabelo e unhas. As infecções causadas pelos dermatófitos são de grande importância clínica, pois também acometem indivíduos imunocomprometidos podendo causar infecções invasivas. O genoma de diferentes espécies e linhagens de dermatófitos foi recentemente sequenciado, neste cenário, a identificação e análise de repetições adjacentes tornam-se importante, pois elas contribuem significativamente para a variação genética e para patogênese de fungos. Dessa forma, este trabalho teve como objetivo a identificação e análise das regiões de repetições adjacentes em genes alvo que possam estar relacionados à patogenicidade e com a interação fungo-hospedeiro em dermatófitos. As sequências utilizadas foram obtidas através do domínio publico do Broad Institute que compila os dados do Projeto Genoma Comparativo Dermatófitos. Um pipeline foi implementado utilizando tecnologias estabelecidas (Linux, HTML, CSS, Asp.NET) para automatização dos processos de identificação, armazenamento e consulta das repetições identificadas. A partir dos dados obtidos, foi possível se traçar o perfil das repetições adjacentes em dermatófitos, bem como comparar a variabilidade das repetições entre espécies e linhagens. A partir das comparações, pôde-se observar que alguns genes relacionados à adaptação ao ambiente e hospedeiro possuem alto padrão de variabilidade em suas repetições. Ainda, observou-se que repetições adjacentes com maior variabilidade são prevalentemente encontradas em genes envolvidos com a regulação da expressão ou, potencialmente envolvidos com fatores de virulência. A partir da análise in silico foram identificados genes ricos em repetições adjacentes variáveis potencialmente envolvidos com a adesão em fungos, especialmente o gene TERG_08771 de Trichophyton rubrum que contém sequências características de adesinas. Um experimento de microarray do nosso grupo de pesquisa comprovou a indução da expressão in vitro desse gene quando T. rubrum foi cultivado em meio de cultura contendo queratina. O gene TERG_08771 também foi induzido quando T. rubrum foi co-cultivado na presença de uma linhagem de queratinócitos humanos. Dessa forma esse gene se mostrou um importante alvo molecular a ser investigado, pois pode estar relacionado a adesão e patogenicidade em T. rubrum. Os resultados obtidos contribuem para anotação do genoma de T. rubrum, como também para um melhor entendimento dos mecanismos moleculares envolvidos com a patogenicidade em dermatófitos.pt_BR
dc.format.extent114 f.pt_BR
dc.language.isopt_BRpt_BR
dc.subjectFungospt_BR
dc.subjectBiotecnologiapt_BR
dc.titleIdentificação e análise in silico de repetições de DNA em fungos dermatófitos envolvidos com patogenicidadept_BR
dc.typeTesept_BR
dc.contributor.advisorSaltoratto, Ana Lucia Fachin


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